‌با پیشرفت روش های تصویربرداری چون آلتراساند، سی تی اسکن و تصویر برداری مغناطیسی ( Magnetic Resonance Imaging: MRI ) طیف گسترده ای از کیست های مغزی در کودکان تعریف شده است. با توجه به اینکه بافت های مختلف و حتی به طور نابجا در مغز وجود دارد، کیست های مادرزادی یا اکتسابی و خوش خیم یا بدخیم در مغز رخ می دهد. کیست ها در مغز بصورت داخل محوری(در نسج مغزی) یا خارج محوری قرار می گیرند. ضایعات شبه کیستی، کیست های آراکنوئید، کیست های مادرزادی و کیست های کلوئیدی شایعترین ضایعات کیستی مغز هستند. کیست های مغز به تغییرات طبیعی، کیست های ناشی از صدمات قبل از تولد، کیست های تکاملی مادرزادی، کیست های توموری، کیست های تروماتیک و تغییرات شبه کیستی تقسیم بندی می شوند. با جمع آوری اطلاعات تصویربرداری از کیست های مغزی چون قوام، محل قرارگیری، وجود آهکی شدن، ادم دور ضایعه و نوع آن، اندازه ضایعه و مشخص کردن علائم و ویژگی های پاتوگنومونیک ضایعه و نحوه تشدید می توان با مرور تشخیص های افتراقی، محتمل ترین تشخیص را مطرح نمود .